Tematyka prac dyplomowych
Tematyka prac dyplomowych w roku akademickim 2015/16 (tryb specjalny studiów)
- Optymalizacja warunków dimeryzacji i oligomeryzacji cystatyny C i jej wariantów
- Synteza i badanie stabilności wobec elastazy peptydu o potencjalnych właściwościach regeneracyjnych.
- Synteza peptydów RKKcyklo(CRQRRQC)PI i RKKRcyklo(CQRRQC)PI - cyklicznych analogów modulatora Tat2 ludzkiego proteasomu 20S
- Synteza peptydu o sekwencji GKKKKKLP-D-Pro-RWG potencjalnego modulatora aktywności proteasomu 20S.
- Potencjalne inhibitory agregacji ludzkiego osoczowego białka amyloidu A
Tematyka prac dyplomowych w roku akademickim 2014/15
- Rola strukturalna mostków disulfidowych w peptydach i białkach. Metody badania konformacji układów polipeptydowych.
- Peptydy antybakteryjne – cechy budowy, mechanizm działania, wykorzystanie w terapii.
- Agregacja białek. Zastosowanie spektroskopii fluorescencyjnej do badania agregacji.
- Metody oznaczania sekwencji epitopowych dla przeciwciał monoklonalnych. Porównanie efektywności wiązania się z przeciwciałami monoklonalnymi dla wariantów cystatyny C w porównaniu do typu dzikiego
- Przeciwciała mono- i poliklonalne w terapii chorób o podłożu amyloidogennym. Porównanie efektywności wiązania się z przeciwciałami monoklonalnymi dla wariantów cystatyny C w porównaniu do typu dzikiego
- Bacytracyna jako antybiotyk peptydowy. Optymalizacja metody tworzenia pierścienia tiazolinowego w warunkach syntezy na nośniku stałym
- Zastosowanie spektroskopii fluorescencyjnej w badaniach strukturalnych białek
- Porównanie zdolności rozdzielczej żeli stosowanych w analizie wybranych biomolekuł za pomocą sączenia molekularnego.
- Izolacja i/lub oczyszczanie biologicznie aktywnych biomolekuł oraz analiza otrzymanych frakcji przy użyciu technik spektroskopowych.
- Analiza składu cukrowego wybranych polisacharydów przy użyciu metod chemicznych i spektroskopowych.
- Charakterystyka właściwości spektralnych i fotofizycznych pentapeptydów modyfikowanych 3-[2-(2-metoksy-4-dimetyloaminofenylo)benzoksazol-5-ylo]alaniną
- Charakterystyka właściwości spektralnych i fotofizycznych pentapeptydów modyfikowanych 3-[2-(2-chinolilo)benzoksazol-5-ylo]alaniną
- Synteza nowych znaczników fluorescencyjnych
Tematyka prac dyplomowych w roku akademickim 2013/2014
- Badania konformacyjne peptydów i białek – stosowane techniki
- Przesyłanie sygnałów allosterycznych jako metoda regulacji aktywności enzymów i receptorów
- Modyfikacje peptydów i białek w celu badania ich właściwości
- Problemy związane z badaniem białek membranowych
- Spektrometria mas w badaniach peptydów i białek
- Zastosowanie wymiany izotopowej proton-deuter do badań strukturalnych
- Elektroforeza jako technika analizy makromolekuł - przykłady zastosowań
- Ilościowa i jakościowa analiza białek za pomocą elektroforezy SDS PAGE
- Aparatura stosowana w spektroskopii fluorescencyjnej oraz możliwości jej zastosowania do badań peptydów i białek.
- Właściwości fotofizyczne fenyloalaniny i tyrozyny oraz zastosowania tych fluoroforów w badaniach peptydów i białek.
- Tryptofan jako fluorofor i jego zastosowanie w badaniach właściwości peptydów i białek.
- Charakterystyka wybranych znaczników fluorescencyjnych stosowanych w badaniach właściwości peptydów i białek.
- Receptory komórek limfatycznych T.
- Prezentacja antygenu w komórkach nowotworowych
Tematyka prac dyplomowych w roku akademickim 2012/2013
- Metody chemicznej syntezy białek
- Synteza trudnych sekwencji peptydowych
- Testy kolorymetryczne w organicznej syntezie na nośniku stałym
- Mechanizmy toksyczności białek amyloidogennych
- Przesyłanie sygnałów allosterycznych w proteasomie
- Wpływ krótkich peptydów na fibrylizację polipeptydów/białek
- Spektrometria mas w badaniach peptydów i białek
- Elektroforeza jako technika separacji i analizy makrocząsteczek – przykłady zastosowań
- Immunoterapia
Tematyka prac dyplomowych w roku akademickim 2011/2012
- Natywna chemiczna ligacja jako metoda chemicznej syntezy białek.
- Wpływ krótkich peptydów na fibrylizację polipeptydów/białek.
- Proteasom a choroby neurodegeneracyjne
- Allosteryczne modulatory aktywności proteasomu
- Spektrometria mas w badaniach peptydów i białek.
- Wykorzystanie testów immunoenzymatycznych do badania oddziaływań miedzy białkami.
- Elektroforeza i jej zastosowanie w badaniach białek ze szczególnym uwzględnieniem elektroforezy dwuwymiarowej
- Enzymy proteolityczne i ich zastosowanie w badaniach sekwencji peptydów i białek
- Selektywna proteoliza jako metoda badania budowy przestrzennej białek.
Tematy prac dyplomowych w roku akademickim 2010/2011
- Syntetyczne chemoterapeutyki przeciwbakteryjne.
- Cele komórkowe dla antybiotyków.
- Białka rekombinantowe jako nowoczesne terapeutyki.
- Genetycznie modyfikowane organizmy - szanse i zagrożenia.
- Ciałka inkluzyjne – dr. Jakyll czy Mr. Hyde?
- Keratyna (budowa, funkcje, zastosowanie oraz metody izolacji).
- Kolagen (budowa, funkcje, zastosowanie oraz metody izolacji)
- Elastyna (budowa, funkcje, zastosowanie oraz metody izolacji)
- Przeciwciała – funkcja, budowa, metody oznaczanie epitopu i paratopu
- Białko surowicze amyloidu A – oddziaływanie z innymi białkami.
- Porównanie struktur krystalicznych ludzkiej cystatyny C i jej mutantów