Prace magisterskie
Drodzy Studenci!
Serdecznie zapraszamy do wykonywania prac magisterskich w Pracowni Chemii Związków Biologicznie Czynnych, działającej w ramach Katedry Biochemii Molekularnej.
Tematyka badań realizowanych w naszej Pracowni obejmuje projektowanie i syntezy różnego rodzaju związków biologicznie czynnych, takich jak peptydy, peptydowe kwasy nukleinowe (PNA), związki o właściwościach neuroprotekcyjnych i pro-regeneracyjnych, niebiałkowe pochodne aminokwasowe (wykorzystywane m.in. do otrzymania triazolowych kwasów nukleinowych), a także koniugaty peptydów z innymi związkami biologicznie czynnymi (np. wankomycyną, dopaminą, PNA). Zajmujemy się również poszukiwaniem nowych związków przeciwwirusowych blokujących replikację wirusa HIV poprzez wiązanie się z jego RNA. Zsyntezowane związki są przedmiotem badań o charakterze interdyscyplinarnym (wykonywanych we współpracy z innymi ośrodkami naukowymi), których celem jest określenie aktywności biologicznej tych związków (m.in. cytotoksyczności, aktywności przeciwdrobnoustrojowej, przeciwnowotworowej, antyparkinsonowskiej, trwałości w płynach fizjologicznych, zdolności do pokonywania bariery krew mózg lub tworzenia trwałych kompleksów z kwasami nukleinowymi: DNA i RNA). Związki będące przedmiotem badań mają istotne znaczenie ze względu na potencjalne możliwości ich wykorzystania w diagnostyce medycznej i/lub terapii farmakologicznej.
Nasza Pracownia dysponuje bogatym warsztatem syntetycznym i analitycznym, m.in. automatycznym i półautomatycznym syntezatorem peptydów, syntezatorem mikrofalowym, analitycznymi i preparatywnymi chromatografami cieczowymi (HPLC, UHPLC i LC-MS), spektrometrem mas, aparatami do elektroforezy kapilarnej, fluorymetrem. Magistrantom oferujemy wsparcie merytoryczne oraz możliwość własnej propozycji tematu badawczego.
Doświadczenie (zarówno wiedza teoretyczna jak i praktyczna) zdobyte w trakcie wykonywania pracy magisterskiej w naszej Pracowni może stanowić solidne podstawy do dalszego rozwoju kariery naukowej lub zawodowej.
Propozycje tematów prac magisterskich:
- Synteza oraz badanie właściwości peptydów penetrujących komórkę (CPP)
- Projektowanie i synteza peptydowych kwasów nukleinowych (PNA)
- Synteza oraz charakterystyka 1,2,3-triazolowych aminokwasów i ich pochodnych
Tematy prac magisterskich zrealizowane w poszczególnych latach:
Rok akademicki 2022/2023
Katarzyna Prochera - opiekun dr hab. Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza koniugatów peptydów Tat(47-57) i PTD4 z pochodną wankomycyny modyfikowaną na grupie aminowej
Dominika Cimek - opiekun dr hab. Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza koniugatów peptydów penetrujących komórkę z pochodną wankomycyny modyfikowaną na grupie karboksylowej
Paulina Tonko - opiekun dr hab. Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Oznaczanie zawartości S-nikotyny w wybranych produktach tytoniowych za pomocą metody HILIC-MS/MS
Izabella Lublak - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza metodą click kwasu N-Fmoc-2-(4-(aminoetylo)-1H-1,2,3-triazolo-1-yl)octowego
Roma Wasielewska - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Peptyd penetrujący błonę komórkową Pep-1: znakowanie i charakterystyka fizykochemiczna
Rok akademicki 2020/2021
Klaudia Micka - opiekun dr hab. Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Chemiczna synteza fragmentu podjednostki S1 wirusa SARS-CoV-2 o potencjalnej aktywności przeciwwirusowej
Natalia Stefaniuk - opiekun dr hab. Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza peptydów o aktywności przeciwwirusowej ukierunkowanej na SARS-CoV-2
Rok akademicki 2019/2020
Alicja Dawicka - opiekun dr hab. Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Projektowanie i chemiczna synteza peptydowych kwasów nukleinowych (PNA) jako potencjalnych inhibitorów furyny
Rok akademicki 2018/2019
Wojciech Kowalski - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza i analiza analogów RGD
Rok akademicki 2016/2017
Natalia Zawadzka - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza koniugatów transportanu 10 z biologicznie czynnymi związkami
Agata Tabor - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza N9-(2-azydoetylo)guaniny
Rok akademicki 2015/2016
Ewelina Backtrog - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza koniugatu transportanu 10 z dopaminą
Aleksandra Andruszkiewicz - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza analogów galaniny i ocena ich powinowactwa do receptorów GALR2
Kamila Szocik - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza i charakterystyka aminokwasów zawierających pierścień triazolowy (TzAA)
Rok akademicki 2014/2015
Arkadiusz Kociuba - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza analogów transportanu 10 jako substratów wykorzystywanych w reakcji 1,3-dipolarnej cykloaddycji Huisgena
Natalia Skerka - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza koniugatu fragmentu białka Tat(47-57) z wankomycyną
Rok akademicki 2013/2014
Agnieszka Kozłowska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza i zastosowanie ludzkiej galaniny znakowanej lantanowcem do oceny oddziaływań ligand-receptor
Dorota Ryszewska - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza 1-karboksypochodnych 1,2,3-triazoli
Rok akademicki 2011/2012
Alina Kupczyńska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza koniugatu PNA-PTD-4 z wykorzystaniem reakcji cykloaddycji azydkowo-alkinowej Huisgena
Katarzyna Milewska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza [Ala50,51,52,55,57]Tat(47-57) oraz jego analogu zwierającego sondę fluorescencyjną
Sylwia Moroz - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza alkilowych pochodnych tyminy
Karolina Sobisz - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza pochodnych alkinowych kwasów karboksylowych
Anna Miszka - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Kwas propargilowy i jego pochodne w syntezie organicznej
Rok akademicki 2010/2011
Patrycja Głuchowska - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza N1 podstawionych azydkowych pochodnych tyminy
Julia Haracz - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza koniugatu PTD-4-G-Lys-PNA specyficznego inhibitora białka STAT1
Justyna Woluszewska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza analogu tansportanu-10 modyfikowanego w pozycji 12 i 15 resztą lizyny oraz w pozycji 17 resztą kwasu 2-aminoizomasłowego
Katarzyna Jankiewicz - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza hybrydowego analogu PTD-4-mitoparanu o potencjalnych właściwościach przeciwdrobnoustrojowych i/lub przeciwnowotworowych
Rok akademicki 2009/2010
Michał Dobkowski - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza azydkowych i alkinowych substratów reakcji Huisgena
Milena Maciuszek - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza pochodnych ornityny zawierających nukleozasady
Rok akademicki 2008/2009
Monika Wojciechowska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza nukleozydowych pochodnych aminokwasów
Aleksandra Szychowska - opiekun dr hab. Piotr Mucha, prof. UG
Tytuł pracy: Synteza analogu systeminy zawierającego resztę kwasu propynowego na N-końcu
Rok akademicki 2007/2008
Aleksandra Szczepańska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza analogów transportanu-10 o potencjalnej aktywności przeciwbakteryjnej
Elżbieta Lus - opiekun dr hab. Piotr Mucha
Tytuł pracy: Analiza biomolekuł metodą elektroforezy kapilarnej w pokrywanych kapilarach
Rok akademicki 2006/2007
Jolanta Kamińska - opiekun dr hab. Piotr Mucha
Tytuł pracy: Synteza map peptydowych i modyfikacji posttranslacyjnych białek metodą elektroforezy kapilarnej
Rok akademicki 2005/2006
Weronika Liszka - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza analogów transportanu zawierających zasady nukleinowe
Anna Swital - opiekun dr hab. Piotr Mucha
Tytuł pracy: Synteza nukleozydowych analogów transportanu
Rok akademicki 2004/2005
Magdalena Syta - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza monomerów analogów PNA oraz peptydów zawierających te monomery
Brygida Lewandowska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza analogów fragmentu galaniny modyfikowanych w pozycji 14 pochodnymi lizyny zawierającymi w łańcuchach bocznych zasady nukleinowe
Rok akademicki 2003/2004
Anna Tarasiuk - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza pochodnych aminokwasów zawierających w łańcuchach bocznych zasady azotowe i ich wykorzystanie w syntezie peptydów
Joanna Rakowska - opiekun dr Jarosław Ruczyński
Tytuł pracy: Synteza analogów fragmentu galaniny modyfikowanych w pozycji 14 pochodnymi lizyny zawierającymi w łańcuchach bocznych nukleozydy
Olga Podkowska - opiekun dr Piotr Mucha
Tytuł pracy: Synteza polipeptydów zawierających w łańcuchach bocznych nukleozydy
Rok akademicki 2002/2003
Mariola Olkowicz - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza pochodnych aminokwasowych zawierających zasady azotowe w łańcuchach bocznych oraz ich wykorzystanie w syntezie peptydów
Anna Kozłowska - opiekun dr Piotr Mucha
Tytuł pracy: Synteza dendrymerowych ligandów wiążących TAR RNA wirusa HIV-1
Rok akademicki 2000/2001
Jolanta Soroko - opiekun dr Agnieszka Szyk
Tytuł pracy: Synteza analogów N-końcowego fragmentu galaniny modyfikowanych w pozycjach 6, 8 lub 14
Renata Szmurło - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Chemiczna synteza galaniny oraz jej hybrydowego analogu zawierającego fragment galaniny i C-końcowy fragment endoteliny-1
Rok akademicki 1999/2000
Jolanta Goślicka - opiekun dr Agnieszka Szyk
Tytuł pracy: Analogi fragmentu białka Tat o ograniczonej swobodzie konformacyjnej
Magdalena Woszczyna-Dalek - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza analogów fragmentu galaniny 1-15 podstawionych w pozycji 14
Rok akademicki 1998/1999
Małgorzata Dullek - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza N-końcowego fragmentu Galaniny Gal(1-15)NH2 i jej analogów ze zmianami w pozycji czwartej
Mariusz Adamczyk - opiekun dr Piotr Mucha
Tytuł pracy: Próby sprzęgania polipeptydów z białkami za pomocą kwasu 1,2,3-tiadiazolo-4-karboksylowego
Joanna Stobińska - opiekun prof. dr hab. Piotr Rekowski
Tytuł pracy: Synteza fragmentów fosfatazy białkowej 2A z fosforylowaną resztą tyrozyny